Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRXP46100 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms