Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMPOP42166 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPOP42166 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPOP42166 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms