Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOLR3P41439 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms