Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPARGP37231 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPARGP37231 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPARGP37231 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms