Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF2P35227 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms