Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBP1P32455 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBP1P32455 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBP1P32455 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms