Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTX2P32243 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTX2P32243 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms