Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3AP31941 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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