Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms