Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5DP30049 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms