Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPREP23469 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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