Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKACBP22694 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms