Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RAB5AP20339 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5AP20339 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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