Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF1BP20333 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms