Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME1P15531 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME1P15531 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME1P15531 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME1P15531 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME1P15531 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME1P15531 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms