Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT10P13645 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT10P13645 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT10P13645 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT10P13645 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT10P13645 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms