Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL2P13500 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL2P13500 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL2P13500 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms