Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHGAP10645 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHGAP10645 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHGAP10645 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHGAP10645 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms