Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB7P09629 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB7P09629 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms