Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCG5P05408 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCG5P05408 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCG5P05408 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCG5P05408 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCG5P05408 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCG5P05408 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms