Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCP02774 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCP02774 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCP02774 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCP02774 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCP02774 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCP02774 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCP02774 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCP02774 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCP02774 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms