Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF254O75437 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms