Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC9O60706 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms