Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EDIL3O43854 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms