Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLGNO14967 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms