Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms