Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms