Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf172C9J069 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms