Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GMNCA6NCL1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms