Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AUP1Q9Y679 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms