Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms