Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms