Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PKP3Q9Y446 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms