Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REXO2Q9Y3B8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms