Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms