Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms