Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms