Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms