Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RIMS3Q9UJD0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms