Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP25Q9UHP3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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