Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN2Q9UHD9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBQLN2Q9UHD9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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