Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms