Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLKQ9UBT6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms