Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms