Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VPS29Q9UBQ0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms