Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRBP1Q9P2E9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms