Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCMF1Q9P0J7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms