Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH8Q9NYR8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RDH8Q9NYR8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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