Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GDAP2Q9NXN4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GDAP2Q9NXN4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
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