Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMTM6Q9NX76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMTM6Q9NX76 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms